2018年10月，四川省委、省政府决定在威尼斯98488成立中国出土医学文献与文物研究院。2020年，研究院列入第一批全省重点文化研究院建设单位。2022年“出土医学文献文物保护研究数字实验室”入选首批省级哲学社会科学重点实验室名单。2023年获批国家中医药管理局重点研究室“出土医学文献与文物重点研究室”。

研究院院址位于威尼斯98488十二桥校区，建设面积近3000平方米，现有专职研究人员23名，兼职人员14名，并设有一个由中、美、英、日等相关领域内一流专家组成的学术委员会，建有四川省社会科学重点研究基地，已发布课题99项。

研究院已出版《天回医简》、《中医百部经典》大型丛书、《出土医学文献与文物》学术集刊、《天回医简书迹留真》等一批重要研究成果。举办了“2019中国出土医学文献与文物国际学术会议”和“2023出土医学文献与文物学术会议”，国内外学术影响力日益扩大；连续四年举办中医“百部经典”与“冷门绝学”人才能力提升培训班，培养研究生、博士后20余名，人才队伍初具规模；创办扁仓书院和扁仓传习社，编剧《天回》历史舞台剧受到校内外公众好评，参与央视《新闻调查》《简牍探中华》等栏目专题报道，高质高效传播弘扬中华优秀传统文化。

目前，研究院承担国家社科基金重大项目子课题2项、一般项目3项，四川省社科基金特别重大委托项目1项，其它省部级以上课题21项。研究院全力打造“出土医学文献与文物”特色学术品牌，聚焦“天回医简”再研究，持续开展新出土医学简帛整理、传世中医古籍再整理与新阐释，建立了中医学与考古学融通研究的科研平台，填补了国内空白。